・東京大学（東京都文京区）
・京都大学（京都府京都市）
・四大学連合（東京都国立市など） or 大阪大学（大阪府豊中市）
東京大学、京都大学に次ぐ総合大学となれば、入試難易度や研究力の点で大阪大学、一般知名度や就職力の点で慶應義塾大学（東京都港区）ということになるだろうが、各分野でこれらの大学を凌駕するのが社会科学系単科の一橋大学（東京都国立市）と理工系単科の東京工業大学（東京都目黒区）。この2校に東京外国語大学（東京都府中市）と東京医科歯科大学（東京都文京区）を加えた4校の間で締結された「四大学連合」の名が徐々に認知されつつあり、これをもって一つの大学とみなして「三大大学」の一角に加えることも可能だろう。