・琵琶湖（滋賀県）
・霞ヶ浦（茨城県）
・サロマ湖（北海道）
面積は、琵琶湖が669k㎡、霞ヶ浦が168k㎡、サロマ湖が150k㎡、猪苗代湖（福島県）が105k㎡、中海（鳥取県・島根県）が87k㎡の順。この面積の上位3湖をもって「三大湖」とされるが、今も昔も琵琶湖の存在感が頭一つ抜けている。
なお、最大水深の上位3湖は、423mの田沢湖（秋田県）、363mの支笏湖（北海道）、327mの十和田湖（青森県・秋田県）。貯水量の上位3湖は、27.5k㎥の琵琶湖、20.9k㎥の支笏湖、8.2k㎥の洞爺湖（北海道）となる。
資料：日本の湖ランキング